このページの目次• ヘキサンはメタンやプロパン、ブタンの仲間 ヘキサンと聞いても分からない人も、メタンやプロパン、ブタンと聞くと、「ガス」「燃料」と思い浮かべるでしょう。 都市ガスはメタンです。 また、ブタンは登山用の携帯コンロに使うガスです。 炭素(C)と水素(H)だけからできている物質で、空気中で点火すると多量の熱を発生して燃焼します。 まず、構造を見てください。 全く同じです。 炭素数が増えて横に長くなります。 このように、炭素(C)同士が単結合の炭化水素をアルカンと呼びます。 炭素の数が増えると融点・沸点は高くなる 高校生向けの参考書にはこんな表が出ていました。 これを見ていくと、性質がわかります。 メタンやプロパン、ブタンは気体でヘキサンは液体 炭素数、つまりCの数が小さい時は常温で気体です。 メタンもプロパンもブタンも常温では気体で、火をつければすぐにボーッと燃えます。 表の分子式を見ると、炭素の数が分かります。 炭素数5のペンタンから炭素数10のデカンまで、常温では液体です。 ヘキサンも常温では液体です。 溶媒(ようばい)については少し後で説明します。 ヘキサンの形を直鎖状アルカンといいます。 アルカンというのは、鎖式飽和炭化水素のことで、読んで字のごとく、直線的に並んだ炭素の腕のすべてに水素が結合しているものです。 分子式 C 6H 14であり、示性式CH 3 CH 2 4CH 3で表されます。 ヘキサンの構造式は簡略化されたものだと下図のようになります。 炭素と水素だけで構成されていますから、何の記号も出て来ません。 これだとわかりにくいので、久しぶりに炭素と水素を全部書いた構造式を上に載せました。 5個の構造異性体がある さらにヘキサンには、分子式 C 6H 14の構造異性体がヘキサンも含めて5つあります。 他の異性体と区別するため、ヘキサンは、n-ヘキサン(ノルマル:「普通」)とも呼ばれます。 油の抽出に使用されるのは、下図のn-ヘキサンです。 ヘキサンの性質 ヘキサンは常温では無色透明で、灯油の様な臭いがする液体。 常温では液体です。 この 沸点は重要なので、太字にしておきました。 ヘキサンは溶媒としてよく使われます。 溶媒とは、他の物質を溶かす物質のことをいいます。 たとえば油性ペンキは水に溶けないですがシンナーには溶けますね。 そのシンナー(薄め液)が溶媒です。 溶けるもの、この場合油性ペンキは溶質といいます。 ウイキペディアにはこのように書かれています。 溶媒(ようばい、英: solvent)は、他の物質を溶かす物質の呼称。 工業分野では溶剤(ようざい)と呼ばれることも多い。 最も一般的に使用される水のほか、アルコールやアセトン、ヘキサンのような有機物も多く用いられ、これらは特に有機溶媒(有機溶剤)と呼ばれる。 () 溶媒と溶質は大別すると「極性(親水性)」と「無極性(疎水性)」とに区分することができるそうです。 極性といわれると化学の知識がない私は困ってしまうので少し調べました。 親水性、 疎水性といってもらうと意味がわかります。 水に溶けるかどうかということです。 塩は水に溶けますが(親水性)、油は水に溶けません。 (疎水性) 極性溶媒は極性物質との組み合わせが良く、無極性溶媒は無極性物質との組み合わせがよいとされ、これは「似たものに溶ける」といわれる性質だそうです。 このあたりは深く追求する必要がないので、そういうものだと思っておきましょう。 油は水に溶けないというのが象徴的なことです。 ヘキサンはガソリンに多く含まれていて、ベンジンの主成分です。 パーツクリーナーにも使われているので、メカが好きな人は、「ああ、あのにおいか」とお分かりになるでしょう。 ヘキサンには毒性もあります。 油を抽出する ヘキサンは油脂抽出に使われています。 大豆油はヘキサンを溶剤として油脂を抽出したものです。 大豆は油脂含量が少なく、20%程度しかありません。 そのため、ただ圧搾しただけではうまく油を得られないのです。 また、なたねトウモロコシなど油脂含量が多い原料の場合も、圧搾して油脂をしぼったあとの搾りかす(油粕)からさらに油脂を抽出するために使われます。 具体的にどのように使われるか 実際、どのような作業をするのか調べてみました。 昔の特許を調べていくと、 特開昭56-32596「食用油脂の製造法」に事例が出ていました。 この発明の実施例では、原料をなたねとして、n-ヘキサンを溶媒として使用していました。 実施例は、おそらく実験室での製造例ですが、規模が大きくなり工業的に生産する場合も原理は変わりません。 なたねを使った実施例はこのように書かれていました。 5kgを得た。 焙煎したなたねを、ローラーをかけてペッタンコにして粉砕します。 その上で、「ソックスレー型大型抽出機」という機械の中で、4時間かけてn-ヘキサンに油を溶かし出します。 抽出ミセラとは、油分を多く含んだn-ヘキサン溶液のことです。 ソックスレー型大型抽出機 ソックスレー型大型抽出器について調べていたら、ソックスレー抽出の原理が書かれているイビデンエンジニアリング株式会社のページを発見しました。 こちらのページには写真も出ていますので、見ていただいた方が理解しやすいです。 ソックスレー抽出では固体状の物質から、溶剤を使って溶剤に可溶な目的成分を溶解、抽出することができます。 ソックスレー抽出器は、最下部にヒーターと溶媒を入れた容器、中間に固体の試料を入れたろ紙が入る筒、最上部に冷却管がついた装置です。 溶媒容器を加熱すると溶剤は蒸発し、最上部の冷却管で冷やされて、固体試料に滴り落ち、溶媒可溶分を少量溶かしこんだ後、溶媒容器へと戻ります。 溶媒可溶分は溶媒より沸点が高いため、このサイクルを繰り返すことで、溶媒容器内には徐々に溶媒可溶分が濃縮され、ろ紙内に溶剤不溶分が残ります。 還流する溶媒は目的成分を含まないので飽和することなく、比較的少量の溶媒で効率よく抽出できるのが利点です。 ヘキサンを循環させて油を溶かし出す仕組み ソックスレー抽出器は、少量のヘキサンを使って(この場合)なたねから油を抽出することができる機械です。 最初にn-ヘキサンを加熱して蒸発させ、上で冷やして滴り落ちる仕組みが、動力を使わないで溶媒を繰り返し循環させることを可能にしています。 ローラーをかけてペッタンコにして粉砕された、なたねに、何度も何度もn-ヘキサンを上からかけて含まれている油を溶かし出すのです。 油は溶媒容器にたまっていく 油はヘキサンに溶けます。 そして元の溶媒容器にたまります。 溶媒容器には、油が残ります。 一方、油の沸点は、油が単一の物質ではなく、脂肪酸によって変化します。 この機器の中で、油は溶媒容器にたまっていきます。 そして、n-ヘキサンに溶けないものは、ろ紙に残る仕組みです。 ヘキサンは減圧して加温して蒸発させる その後、n-ヘキサンは、蒸留缶で蒸発させられます。 完全に蒸発させるためです。 減圧すると沸点が下がる 減圧すると沸点が下がります。 それと同じことです。 減圧したうえに、もともとの沸点以上の温度に上げるのですから、原理としてはn-ヘキサンは、完全に蒸発してしまうでしょう。 NOTE 調べられたら別な記事に詳しく書くつもりですが、大豆油の溶剤を使った抽出は、イギリスで始まり、もともとはベンゼンが使われ、特許も取得されていたようです。 しかし、ベンゼンは発がん性があるなど人体にはひどく有害なことが分かり、溶剤として使われなくなりました。 その後、ヘキサンが使われるようになりました。 この記事を読んで、溶剤ヘキサンを使った油なんて嫌だなあと思う人がいらっしゃると思います。 しかし、理科の先生や化学を学んでいる人はほとんど気にしないのではないかとも思います。 何が正解なのか私は正直なところ分からないのですが、もし、抽出した油が嫌いなら、価格の高い一番搾りの植物油かバターやラードなど動物性の脂を使う方法もあります。 ヘキサンを溶剤とする油の抽出方法は、根こそぎ抽出できるらしいので、無駄がありません。 植物油の価格がとても安いのは、溶剤によって抽出されることが理由なのは間違いありません。
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タンパク質抽出方法の概要 タンパク質の抽出は、用いる試料(大腸菌、動物由来細胞、植物組織など)と目的タンパク質の局在(細胞質、細胞壁、培養上清など)に応じて、最適な方法を選択する必要があります。 一般的に用いられる方法について、「温和な条件でのタンパク質抽出方法」と「より強力なタンパク抽出方法」に分けて例を挙げます。 温和な条件でのタンパク質抽出方法 ここで挙げる細胞溶解法は、培養細胞・血液細胞・微生物など簡単に破砕できるサンプルでよく用いられます。 また、細胞の特定画分( 細胞膜、核、細胞質など)のみを調製するときにも用いられます。 浸透圧で溶解した細胞を酵素処理する方法や界面活性剤存在下で凍結解凍する方法など、これらの手法をいくつか組み合せた方法も有効です。 浸透圧ショック法 リゾチームを用いた大腸菌タンパク質の抽出 一般プロトコール• 0 タンパク質抽出用キットの使用 ペッスル(すりこぎ)とマイクロチューブのタンパク質抽出キットです。 破砕用のビーズレジンも含まれています。 【特徴】 マイクロチューブ中のレジンが破砕効率を高め、短時間で処理が可能です。 【適用サンプル例】 細胞懸濁液 (100 mgまでのサンプルを処理可能) プロテアーゼによる分解を抑えるには 細胞を破砕すると内在性のプロテアーゼが細胞から放出されます。 目的のタンパク質が分解されないようプロテアーゼ活性を阻害する必要があります。 プロテアーゼの阻害方法としては、以下のような手法が用いられています。 実際にはこれらの方法を組み合せることで、プロテアーゼによる分解を効果的に阻害する方法がとられています。 当社は個人情報を業務委託先に預ける場合がありますが、個人情報の取扱いに関する法令、国が定める指針その他の規範に従い、委託先に対する必要かつ適切な監督を行います。 個人情報に関するお問い合わせは総合お問合せ窓口(03-5331-9336:営業日 9:00〜12:00、13:00〜17:30)にて承ります。
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BioTechnicalフォーラム [TRIzolを使っての脂質を多く含む組織からのRNA抽出 ]• バイオ関連の実験をする上での、試薬、機器、プロトコールなどの情報交換の場です。 新しいテーマで話を始める場合、質問をする場合は「」から書き込みをしてください。 質問に対して解答できる方は是非、書き込んで下さい。 このフォーラムにふさわしくないと管理人が判断した投稿は予告なく削除します。 TRIzolを使っての脂質を多く含む組織からのRNA抽出 No. TRIZolを用いたマウスの各組織 心臓、肝臓など からのRNAの抽出を、説明書のやり方に従って 1 1mlのTRIZol中に組織50-100mgを入れてホモジェナイザーにかける 2 0. 新しいラボに移って、脂肪組織からRNAの抽出を始めました。 脂肪組織では、上のやり方では 3 の遠心後の層の分離がうまくいきませんでした 透明な層にピンク層が挟まれた形になる。 そこで、ブライダイアー法と一緒で分離がうまくいかない場合はクロロフォルムの量を増やせば良いだろうと、 2 で加えるクロロフォルムの量を0. 4mlにしてみました。 よって、私は加えるクロロフォルムの量を増やすやり方にはなんの問題もないと思うのですが、同僚がケチをつけてきました。 曰く、TRIzolとクロロフォルムの比を変えるなんてけしからん、そんなやり方で取ってきたRNAを使った結果なんて信用ならん、とのことです。 では、正しいやり方を教えて下さいといったところ、自分は知らないが、そんなやり方ではないはずだ、とのことでした。 イチャモンに近いと思うので、真面目に取り合わなくても良いのかもしれませんが、もしかしたら自分が知らないだけで、他にきちんとしたやり方があるのかもしれないと思い、トピを作らせて頂きました。 クロロフォルムを多めに入れる以外の方法を知っておられる方、教えて頂けないでしょうか? よろしくお願いします。 無題 No. triさんの訂正の仰るところは、その取り除く層は透明ではない 多分白く濁っている? ということでよいのでしょうか? 何を思ったか、chloroformを入れた後の遠心後を想像してしまい、「透明」と書いてしまいました。 実際に行っている人間ではないのにコメントするのは申し訳ないのですが、少なくとも赤ではないので、区別がつくのだろうと思います。 こういう場合transfer使って欲しい... removeは、その場所から「取り除く」という意味合いで、必ずしも「捨てる」と直結するわけではないのかな、と思います。 なので、チューブから「remove」して、新しいチューブに「tranfer」する、という記載になるのでしょうね。 きっと、「捨てる」なら「discard」とか書きそうです。 まあ、好みの問題もあると思います。 トピ主さんが新しく採用されたということは、ラボの運営上の問題ではないと思いますが、グラントとれないからラボ閉鎖かポスドク解雇、とか言う話も最近耳にします。 もちろん、猶予期間はあるのですが、突然そんなこと言われたら焦りますよね。 同僚の方も大変だと思いますが、猶予期間内に就職先が見つかるといいですね。 無題 No. --------------------------------------------------------------- オプション:筋肉、脂肪組織および植物の塊茎部のような、タンパク質、脂肪、多糖類または細胞外物質を 大量に含むサンプルは、さらに分離ステップが必要な場合があります。 細胞外膜、多糖類および高分子量 の DNA は沈澱し、RNA は上清に含まれています。 脂肪組織からの検体は、上層に脂肪成分がみられるこ とがありますので除去してください。 得られた RNA 溶液は、新しい RNase free のチューブに移し、クロロホ ルムを添加し、以下のプロトコールへ進んでください。 無題 No. 1 triさんの話ではtop側に不溶性の脂肪分がくるのでこれを取り除く、 2 APさんの"debrisを遠心で落として取り除く"ということであればbottom側を取り除く top側の層を新しいチューブに移してこれを使う ということになると思いますが、どっちでしょう? 私の場合では、triさんのコメントが的を得ていて、top側を取り除くのだと思っております。 ホモジェナイズしきれないdebrisを取り除くのは別の臓器でやったことがありますが、今回の私の場合 白色脂肪 では当てはまらないように思います。 確かにtriさんの二つ目のリンクには in order to separate the insoluble fat materialとあって、次のステップでRemove the cleared homogenate lower phase とありますね。 しかし、これ、このcleared homogenate lower phase に対してクロロフォルムを入れろと書いてますね ステップ8の書き方からみても。 捨て去るわけではなくて。 なので、結局取り除くのはtop側ということですよね。 別ページ では、トラブルシューティングに Centrifuge sample before chloroform addition and remove fat layer on top とあって、これはわかりやすくtop側にfat layerが来るとありますね。 "そのかたも" の "も" はトピ主にかかっているんですよね? 自己弁護の為に書きますが、私自身はlipidとfatの違いは一応わかっているつもりで、lipidからRNAが回収できたりはしないことはわかっております。 ところが同僚は"脂質中のRNA"と言ってるわけで 英語でlipidでした。 それを反映して"脂質"と書いてます 、それで、クビになるのはあなたの知識不足のせい、私のせいじゃないよ、のつもりで書いたんです。 わかりにくかったですかね? それとも、私のコメントから、致命的にわかってないなと判断できるところがあるんでしょうか? もしそうでしたら後学のために教えてください。 無題 No. 要はfat 脂肪組織、脂身)のdebrisを遠心で落として取り除くということです。 これは脂肪組織に限らず、他の材料でもよくやる手順です。 少し誤解があるようですが、Chloroformを入れる前に遠心すると、脂肪はフェノール相の上に透明な層をつくるので、不溶性の脂肪分を除けるということです。 もちろん、多糖類が多い組織とかタンパク質含量が多い組織だと、遠心して沈殿物を取り除くことはありますが、ちょっと意味合いが異なりますよ。 無題 No. 要はfat 脂肪組織、脂身)のdebrisを遠心で落として取り除くということです。 これは脂肪組織に限らず、他の材料でもよくやる手順です。 なんの為に脂肪組織を調べてるかわかってるのか? " そのかたも、fatとlipidの意味するところの違い、つまり脂肪組織と脂質の違いがわかっていないんでしょうな。 fat(脂肪組織)のなかにはもちろんRNAがあるけれど、それをlysisした内容物であるlipidやdebriにはRNAは含まれない(そういうものたちからRNAを抽出する操作をしているのだ)ということ、理解しているのでしょうか。 triさん、monさん、コメントありがとうございます。 なぜか見逃していました。 ありがとうございます。 次回はこれを試してみようと思います。 リンク先の説明では、クロロフォルムが1:1の場合にはDNAのコンタミネーションの可能性あり、その一方でRNAの回収率が最大になることも見込まれるとありますね。 cDNA合成の際、逆転写酵素抜きのチューブを一本作っているのですが、これでは全くバンドが見られなかったので、DNAのコンタミは今回の私の場合では無視できるレベルなのかと思います。 次回遠心して脂質を除いてからのRNA抽出を試してみて、回収率の違いをみてから、どちらの方法 クロロフォルム0. 4ml 又は まず遠心で脂質を除く でいくか決めようと思います。 場合によっては、遠心で脂質を除いてからクロロフォルム0. 4mlもありかもしれません。 monさんと同じく、どのみちTRIZolだけではDNAのコンタミは避け得ないと私も思いますので、回収率とコンタミのトレードオフを考えながら実験していこうと思います。 残念ながらそれほど資金の潤沢なラボでは無いので、TRIZolの二回使いはちょっと難しいです。 仰る通り、最終的には脂質のほとんどは除けていると思います。 同僚に関して、まさにこのトピを上げた直後に、別の同僚から"なんか絡まれてるみたいだけど、君が来たことでクビが確定したためだから、流しとけばいいよ"とのことでした。 それでも、せっかくなのでトピで教えて頂いたことを伝えようと話してみたところ、"脂質を先に除いたら、脂質中のRNAを捨てることになるでしょ! なんの為に脂肪組織を調べてるかわかってるのか? "とのことでした。... マジですか... クビになるのは私のせいじゃないよ。。。 TRIzolを使っての脂質を多く含む組織からのRNA抽出 No. TRIZolを用いたマウスの各組織 心臓、肝臓など からのRNAの抽出を、説明書のやり方に従って 1 1mlのTRIZol中に組織50-100mgを入れてホモジェナイザーにかける 2 0. 新しいラボに移って、脂肪組織からRNAの抽出を始めました。 脂肪組織では、上のやり方では 3 の遠心後の層の分離がうまくいきませんでした 透明な層にピンク層が挟まれた形になる。 そこで、ブライダイアー法と一緒で分離がうまくいかない場合はクロロフォルムの量を増やせば良いだろうと、 2 で加えるクロロフォルムの量を0. 4mlにしてみました。 よって、私は加えるクロロフォルムの量を増やすやり方にはなんの問題もないと思うのですが、同僚がケチをつけてきました。 曰く、TRIzolとクロロフォルムの比を変えるなんてけしからん、そんなやり方で取ってきたRNAを使った結果なんて信用ならん、とのことです。 では、正しいやり方を教えて下さいといったところ、自分は知らないが、そんなやり方ではないはずだ、とのことでした。 イチャモンに近いと思うので、真面目に取り合わなくても良いのかもしれませんが、もしかしたら自分が知らないだけで、他にきちんとしたやり方があるのかもしれないと思い、トピを作らせて頂きました。 クロロフォルムを多めに入れる以外の方法を知っておられる方、教えて頂けないでしょうか? よろしくお願いします。 パスワード を入力してチェックした記事を チェックした記事を このトピックにメッセージを投稿する 名前 メール アドレス非公開 タイトル 本文 設定 クッキーを保存(次回の入力の手間を省けます) 上に上げない(トピックの一覧で一番上に移動させません) 解決(問題が解決した際にチェックしてください) 暗証 半角英数字8-12文字の暗証番号を入れると、あとで削除、修正ができます。 送信 〔使い方〕• 「アドレス非公開」をチェックすれば、自分のメールアドレスを公開しないで他の方からメールを受け取れます。 問題が解決した際には、解決ボタンをチェックして解決した旨のコメントをつけてください。 これは、初めにトピックを作った人と管理人のみが可能です。
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